潔凈醫學實驗室通常為整體建筑的的一部分，通常布置在醫療機構的各醫療科室的最內側，這類實驗室的圍護結構通常采用輕質復合結構墻體，要求這類墻體整體性好、拼縫少、有利于建成后的衛生保持，。地面也采用整體性好的地面。由于是潔凈區，通常不設計可開啟的外窗，窗可以采用金屬框架或者合金框架的雙層固定窗。門通常采用金屬壁板門。
一、潔凈醫學實驗室建筑設計
1、無菌實驗室
通常包括換鞋、男女一更、男女二更、緩沖、走廊、無菌實驗室、潔物入口、污物出口。二更可以兼作緩沖間，換鞋可以和一更合并。在建筑面積有限的場所物流出入口可采用傳遞窗代替。
2、PCR實驗室
主要由四個獨立的功能單元構成：樣品和試劑準備區、核酸提取室（標本制備區）、擴增區、產物分析區。每個區之間設置傳遞窗；每個區需要有自己的緩沖間，當不設置統一的人流出入口時，各緩沖間都要兼做各區的更衣室。設計比較好的PCR實驗室可以設計統一的人員出入口、潔物入口和污物出口。
3、PET中心
包括一更、緩沖、二更、氣閘、物流入口、分裝準備室、分裝熱室、熱室后室。比較完善的PET中心還要設計配套的無菌檢測室和陽性對照室。
4、生物安全一級實驗室
可以是一間安裝了生物安全柜的獨立的房間，實驗室的門應有可視窗鎖閉，門鎖及門的開啟方向不應妨礙室內人員的逃生。詳細要求可以參照《實驗室 生物安全通用要求》GB19489-2008。
5、生物安全一級實驗室
宜設置更衣室和主實驗室，主實驗室內設置生物安全柜，主實驗室要求維持微負壓。詳細要求可以參照《實驗室 生物安全通用要求》GB19489-2008。
6、生物安全三級a類實驗室
防護區應包括主實驗室、緩沖間等，緩沖間可兼做防護服更換間；輔助工作區應包括清潔衣物更換間、監控室、洗消間、淋浴間等；生物安全三級b1類實驗室防護區應包括主實驗室、緩沖間、防護服更換間等。輔助工作區應包括清潔衣物更換間、監控室、洗消間、淋浴間等。主實驗室不宜直接與其它公共區域相鄰。詳細要求可以參照《生物安全實驗室建筑技術規范》GB50346-2011。
7、生物安全四級實驗室
防護區應包括主實驗室、緩沖間、外防護服更換間等，輔助工作區應包括監控室、清潔衣物更換間；設有生命支持系統四級生物安全實驗室的防護區應包括主實驗室、化學淋浴間、外防護服更換間等，化學淋浴間可見做緩沖間。詳細要求可以參照《生物安全實驗室建筑技術規范》GB50346-2011。生物安全四級實驗室一般為國家重點工程項目。
改造的潔凈醫學實驗室的室內凈高不宜低于2.5米，新建的潔凈醫學實驗室的室內凈高不宜低于2.6米。
三級和四級生物安全實驗室宜設置設備層，設備層凈高不宜低于2.6米。
二級生物安全實驗室應在實驗室或者實驗室所在建筑內配備高壓滅菌器或者其他消毒滅菌設備。
三級生物安全實驗室應在防護區內設置生物安全型雙扉高壓滅菌器，滅菌器主體一側擁有維護空間。
四級生物安全實驗室主實驗室應設置生物安全型雙扉高壓滅菌器，滅菌器主體所在的房間應為負壓。
二、潔凈醫學實驗室裝飾裝修設計
潔凈醫學實驗室的墻面、頂棚的材料應易于清潔消毒、耐腐蝕、不起塵、不開裂、光滑防水、表面涂層已具有抗靜電性能。通常的材料有各類滿足防滑要求的復合彩鋼板、電解鋼板、鋁板或者不銹鋼板。
潔凈醫學實驗室的地面應采用無縫防滑耐磨、耐腐蝕地面，踢腳與墻面齊平。地面與墻面的相交位置及其圍護結構的相交位置宜做半徑不小于30mm的圓弧處理。通常的地面材料有：彩色自流平地面、PVC卷材焊接地面、橡膠卷材地面等等。
潔凈醫學實驗室的門應能自動關閉、并設置觀察窗，并設置門鎖。實驗室的門宜開向壓力較高的區域。緩沖間的兩個門之間要能夠互鎖。需要打壓測試的區域的門要采用密閉門，密閉門可以是機械壓緊式或者充氣式，當設置充氣式密閉門時，要設置壓縮空氣系統。
三、潔凈醫學實驗室結構設計
無菌實驗室的設計應充分考慮超凈工作臺等大型設備的安裝空間和運輸通道。
PCR實驗室的設計考慮超凈工作臺、通風櫥、生物安全柜等大型設備的安裝空間和運輸通道。
PET中心的設計考慮熱室分裝機的安裝空間和運輸通道。
生物安全實驗室的設計考慮生物安全柜、雙扉高壓鍋、污水處理設備等大型設備的安裝空間和運輸通道。
潔凈醫學實驗室的結構設計要充分考慮超凈工作臺、通風櫥、生物安全柜、離心機、熱室分裝機、生物安全柜、雙扉高壓鍋、污水處理設備的荷載情況。
生物安全實驗室的結構要求要滿足《生物安全實驗室建筑技術規范》GB50346-2011的要求。