1、潔凈廠房的位置選擇
潔凈廠房應盡可能設置在大氣含塵和有害氣體濃度較低、自然環境較好的區域，以減輕潔凈廠房凈化空調系統過濾裝置的負載，從而減少經常的運行能量的消耗。
2、工廠總平面布置
在確保產品生產質量的前提下，盡可能按產品生產工藝要求有序的將各生產車間、輔助生產車間、倉庫、公用動力設施組合為一幢綜合生產廠房，做到縮短各種公用動力管線、減少運輸量或運輸距離，并使某些公用動力設施靠近負荷中心，從而減少能量損耗，提高能源使用效率。
3、潔凈廠房內的工藝平面布置
在進行潔凈廠房內的工藝平面布置時應十分重視貫徹節能的要求。在潔凈室內只能布置有潔凈要求的生產工序、生產設備和必要的房間，且應按不同的空氣潔凈度等級要求分別集中布置，盡大努力減少潔凈室的面積，因為減少潔凈室的面積或減少高級別潔凈室的面積就是降低能耗。在滿足生產工藝和噪聲要求的前提下，要求潔凈度高的潔凈室盡量靠近空調機房，以減少管線長度，減少能耗。
設計潔凈廠房時應仔細了解產品生產工藝特點和要求，正確規劃潔凈室（區），恰當的確定空氣潔凈度等級，精心進行潔凈廠房平面和空間的設計。將工藝生產區、生產服務區、人員凈化、物料凈化和其它輔助用房分區布置，同時考慮生產操作、工藝設備的安裝和維修、管線布置、氣流流型以及凈化空調系統、各種公用動力設施進行綜合協調，既滿足產品生產質量要求的空氣潔凈度等級又只占用較小的潔凈室面積。潔凈室平面和空間布置設計應盡可能采用潔凈小室、潔凈工作臺、層流罩、潔凈隧道、微環境等方式，大可能的降低能耗。實踐表明，合理的降低高級別潔凈室面積是減少能耗、節約能源的有效措施。
4、在進行建筑平面、立面設計時，應貫徹節能要求，與業主和工藝設計人員密切配合。在確定門窗數量、位置、大小和外墻構造、厚度以及立面造型時，既要滿足產品生產工藝要求，使建筑外形美觀、適用，又要符合國家的節能要求，盡量降低能量消耗。例如建筑平面或立面的凹凸變化會使建筑外形活潑生動，但這種變化也會增加外墻的面積，而建筑外墻的熱損耗是建筑能耗的重要組成部分，尤其是潔凈廠房的室內外溫差較大，建筑外墻面積的增加使建筑能耗的增加幅度更大，所以潔凈廠房的建筑外形不可過分追求變化，而可采取與產品特點相適應的一些簡潔、明快的外形和色調，使潔凈廠房造型美觀、大方。潔凈廠房的圍護結構應采用隔熱性能和氣密性好的材料及構造。建筑外墻內側保溫或夾芯保溫復合墻板的推廣應用都是降低建筑能耗的重要措施。
潔凈廠房門窗設計的恰當與否是降低潔凈廠房建筑能耗的重要課題。首先是控制好窗墻比，按潔凈室的特點盡量減少外墻上的窗面積；其次是確保滿足門窗構造的氣密性要求，選擇優質可靠的材料，確保門窗的保溫（冷）效果和減少冷風滲透，防止“冷橋”現象的發生。
5、降低潔凈室的熱（冷）負荷的技術措施
（1）在滿足生產工藝的前提下，從節約能源的角度出發，按不同工序或房間的不同要求確定空氣潔凈度等級、溫度、相對濕度參數，可能就低時盡可能采用較低的取值。
設計潔凈廠房時，應與業主、產品生產工藝技術提供者充分交流，反復討論比較，合理進行潔凈分區規劃，盡可能減少潔凈室面積或減少高級別類潔凈室的面積，這是降低潔凈廠房的熱（冷）負荷的有效途徑。
（2）在產品生產工藝提供者的密切配合下，準確的確定潔凈室需設排風裝置的房間或工序或生產設備的排風量。這是由于潔凈室內排風量的增加意味著凈化空調系統的補充新風量的增加，也就是新風處理能耗的增加。在潔凈廠房設計中有時會出現由于排風量的增加使凈化空調系統的新風量大于規定的新鮮空氣需用量，從而使設計的熱（冷）負荷增加。因此，準確的確定潔凈室內排風量是降低能耗的重要技術措施之一。
（3）加強并落實建筑和設備的隔熱保溫措施。這里包括潔凈室的墻體、地面、吊頂（或屋面）、門窗的構造、材質等是否滿足隔熱保溫要求，能否可靠的確保潔凈室內的溫度、相對濕度要求并盡可能降低熱（冷）損失；加強潔凈室內生產設備的隔熱保溫措施，盡量減少排熱量；加強各類風管、水氣管道的隔熱保溫措施，減少能耗。
（4）設計潔凈廠房時應認真了解和掌握潔凈室內的生產設備負荷率，開工率和運行時間的實際情況，實事求是的計算各類生產設備的發熱量。由于供給生產設備的電能或其它能源在在產品生產過程中大部分轉換給產品或由排風裝置、冷卻水裝置帶走，少部分轉入室內成為凈化空調的一部分熱負荷，這一部分熱量的計算與多種因素有關，因此需要認真、仔細了解并積累必要的基礎數據，盡可能做到較為準確的計算生產設備的發熱量，以便為恰當計算凈化空調系統的熱（冷）負荷提供依據。
（5）準確的核算潔凈室內操作人員的數量。操作人員發熱量也是凈化空調系統熱（冷）負荷的重要組成部分，對潔凈室內操作人員較多的潔凈廠房進行設計時，認真核實人員數量尤為重要。