凈化工程應用范圍較廣的四大領域主要是指：電子工廠、制藥廠、手術室、生物安全實驗室，不同領域凈化控制系統要求各不相同，同時這些領域控制標準可廣泛應用于其他行業，如電子工廠凈化工程的控制系統可用于PCB生產車間、電器、注塑車間等。四大領域凈化工程的控制特點有以下不同。
電子廠潔凈度直接影響到電子產品的質量，采用一次送風、二次送風系統，大量使用FFU風機過濾機組層層凈化空氣，達到更衣室8級凈化、走廊走道7級、生產車間6級，局部需要5級或4級之間，在工程完工后需要靜態驗收。
制藥廠凈化控制三個目標：氣閘室廣泛使用六級標準，控制潔凈室內無交叉污染；CFU是指潔凈室內活菌個數；工程需要獲得國家GMP認證；完成了這三個目標才能是一項合格的凈化工程項目，工程系統需用值班風機局部5極，由藥檢局動態監控，靜態驗收后使用。
手術室控制較為嚴格，采用MAU+AHU系統，送風天花3m*3m,上千級凈化級別，驗收標準為靜態驗收，動態驗收溫度、濕度、CFU。通常情況下患者在做手術時感染率為25%，根據統計目前手術感染率達10%-15%，許多醫院以日常手術感染率為考核手術室凈化工程的優良指標。
生物安全實驗室凈化工程控制特點我國已制訂相關安全條令，工程凈化設備選用生物安全隔離服、獨立供氧系統，廢液、廢氣統一凈化通過嚴密性試驗后處理，采用密閉隔離器，負壓二級屏障系統，保障人身安全，并制訂好完善的生物安全實驗室凈化管理條令。