采暖通風與空氣調節系統（HVAC系統），在中國GMP中稱為空調凈化系統，是制藥廠的一個關鍵系統，它對制藥廠能否實現其向患者提供安全有效的產品目標具有重要的影響。如果藥品生產環境得到妥善的設計、建造、調試、運轉和維護，則有助于確保產品的質量，提高產品的可靠性，同時降低工廠初期的投資成本和后期的運轉成本。
對于制藥廠而言，HVAC系統是企業能源消耗的一個重要組成部分，設計中必須將藥品生產質量管理規范(GMP)和良好工程實踐規范(GEP)融合在一起。同時還需要考慮其它方面的因素，特別是關于如何提供一個清潔、安全的空間環境。
空調凈化系統的原理：通過科學的計算設計，使空氣經過多級過濾，將空氣中的懸浮微粒及微生物清除，達到除菌作用，再經專用管道輸送到潔凈室。它一般由凈化空調機組、輸送風管道系統、管道末端設備及機組自控系統四部分組成。凈化空調機組是潔凈室凈化效果的關鍵，送風模式及風管系統也是重要因素。輸送風管道采用鍍鋅板加工面成，分矩形和圓形兩種，風管施工質量也決定凈化效果的好壞。
潔凈室使用的凈化空調系統與一般空調系統相比有如下特征：
1、潔凈室凈化空調系統是一個多參數、高精度的控制系統
除控制一般空調系統的室內溫度、濕度參數之外，還要控制房間的潔凈度和壓力等參數，并且溫度、濕度的控制精度要求較高，有的潔凈室要求溫度控制在±0.1℃范圍內等。凈化空調系統所控制的潔凈度等參數需要根據該系統所服務的生產環境或潔凈室的潔凈度而具體計算和設定。例如：生產青霉素的車間、生物實驗室、手術室等，因其各自工作時所要求的環境不同，所以參數也不同。
2、潔凈室凈化空調系統是一個過濾系統
凈化空調系統的空氣處理過程除熱、濕處理外，必須對空氣進行預過濾、中間過濾、末端過濾等。有的高級別的潔凈室為了有效、節能的對送入潔凈室的空氣進行處理，采用集中新風處理，僅新風處理系統便設有多級過濾，當有嚴格要求需去除分子污染物時，還應設置各類化學過濾器。在生產某些甾體藥物、青霉素等強效致敏性藥物、高活性藥物、有毒害藥物的排風口應安裝高效空氣過濾器，使這些藥物引起的污染危險降低到Z低限度。
3、潔凈室凈化空調系統是一個氣流組織更有序的系統
一般空調多采用亂流形式達到溫、濕度的均勻。而潔凈室的氣流分布、氣流組織方面，要盡量限制和減少塵粒的擴散，減少二次氣流和渦流，使潔凈的氣流不受污染，以最短的距離直接送到工作區。因必，經常采用一般空調所不用的層流形式。
4、潔凈室凈化空調系統是一個有室內壓力控制要求的系統
為了確保潔凈室不受鄰室或室外污染的污染，潔凈室與鄰室或室外必須維持一定的壓差(正壓或負壓)，最小壓差要在5Pa以上，為此需要一定的正壓風量或一定的排風。為保證潔凈室在正常工作或空氣平衡暫時受到破壞時，潔凈室的潔凈度免受鄰室的污染或污染鄰室，廠房外環境與潔凈室之間、潔凈室與一般房間之間、潔凈度不同的潔凈室之間應保持適當的壓差值。工業潔凈室和一般生物潔凈室都采用維持正壓，如果使用有毒、有害氣體或使用易燃、易爆溶劑或有高粉塵操作的潔凈室，還有生產致敏性藥物、高活性藥物的生物潔凈室及其它有特殊要求的生物潔凈室則維持負的靜壓差（負壓）。不同等級的潔凈室及潔凈區與非潔凈區之間的壓差不小于5Pa，潔凈區與室外的壓差不小于10Pa。
5、潔凈室凈化空調系統是一個風量、能耗均很大的昂貴系統
凈化空調系統的風量較大(換氣次數一般在10次至數百次)，相應的能耗也很大，系統的造價和運行費用也較高。
6、潔凈室凈化空調系統是制作復雜、清潔要求高的系統
凈化空調系統的空氣處理設備、風管材質和密封材料根據空氣潔凈度等級的不同都有一定的要求；風管制作和安裝都必須嚴格按規定進行清洗、擦拭和密封處理等。從經濟角度及不影響空氣凈化效果兩個方面綜合考慮，凈化空調系統風管的制作材料是隨著輸送空氣凈化程度的高低而變的。潔凈度低選用產塵少的材料，潔凈度高選用不易產塵的材料。排風系統風管的制作材料是根據輸送氣體腐蝕性程度的強弱而定的。風管使用的不燃材料是指各種金屬板材；難燃材料是指氧指數大于或等于32的玻璃鋼。用于風管保溫和消聲的不燃材料多是玻璃棉、巖棉等；難燃材料是指氧指數大于或等于32的聚氨酯(或聚苯乙烯)泡沫塑料、橡塑海綿等。穿越防火墻及變形縫防火隔墻兩側各2000m范圍內的風管和電加熱器前后800mm范圍內的風管的保溫材料、膠黏劑、墊片等，均必須采用不燃材料。
7、凈化空調安裝后應按規定進行調試和綜合性能檢測，達到所要求的空氣潔凈度級別，對系統中的高效過濾器及安裝質量均按規定進行檢漏等。