1、環境要求
倉庫設計一般采用全封閉式， 可采用燈光照明和自然光照明。 倉庫周圍般設置窗戶，通常不開啟，防積塵及鼠、蟲進入。窗外安裝鐵柵欄，以保證物品安全。為防止細菌滋生，倉庫內不設地溝、地漏。倉庫內設潔具間，放置專用清潔工具。倉庫內人車通道走向設置合理，寬度適當。
2、庫房分區
按倉儲物質不同，庫房可分為原輔料庫、包裝材料庫、中間產品庫和待包裝產品庫、成品庫，或在同一倉儲區內劃分不同區域擺放不同的物料或產品，各區域間有明顯的隔離措施和標識，防止混淆和差錯。在原輔料、包裝材料進口區應設置取樣間或取樣車，取樣設施常裝有層流裝置。取樣間內只允許放置一個品種一個批號的物料，以免物料混淆。倉儲區的取樣區潔凈級別應與生產要求一致。依據儲存條件，倉庫可分為一般庫、常溫庫、陰涼庫、冷庫、有特殊儲存條件的其它庫，以及化學危險品庫和特殊藥品庫等。常溫庫的溫度為10～30℃，陰涼庫為20℃以下，冷庫為2～10C，倉庫內應安裝溫度調控設備。對于儲存條件或安全性有特殊要求的物料或產品，倉儲區應有特殊儲存區域以滿足物料或產品的儲存要求，如頭孢類、青霉素類、激素類產品應分開放置，并需要吸塑包裝，以免交叉污染:酸性物料與堿性物料一般分庫儲存；腐蝕性大的物料、易揮發性物料應單獨存放等。
3、設備與設施
倉儲區應配置相應的設備與設施，以確保物料、產品得到快速、有效的裝運，并保障藥品質量不發生變化。
（1）裝卸設施設備：叉車、提升機、升降移載機、輸送機、貨梯、電梯等裝卸搬運類設施、設備等。
（2）保管設施設備：貨架或托盤、儲罐、安置空調、除濕機、加濕器、陰涼庫和冷庫的制冷及溫度監控系統、自動噴淋系統、安全柜、保險柜、標簽打印機、條碼掃描器、冷藏運輸箱等。
（3）計量設施設備：電子秤、臺秤或地磅、計量泵等。
（4）養護設施：拖把、抹布、吸塵器、清掃機、水池等。
（5）通風照明設施：普通照明燈具、排風扇(應配置防蟲網)等。
（6）消防安全設施：消火栓、滅火器、滅火毯、緊急逃生通道、緊急逃生圖(包括逃生路線、逃生通道，緊急電話等內容)、緊急出口指示裝置等消防設施和器材，亦可采用自動化程序較高的防盜報警系統、火災自動報警系統、火災噴水滅火系統，實現自動化控制。
（7）勞動保護設施：頭部防護的安全帽、眼睛防護的眼罩、面部防護的面罩、呼吸防護的防毒面具、身體防護衣物等。在接觸酸、堿及易揮發性有毒有害類物料時，應特別注意該類勞動防護設備的配備和使用。