微生物懸浮于空氣中可形成各種各樣的微生物氣溶膠，微生物氣溶膠是指分散相中含有微生物的氣溶膠。根據所需控制的對象和不同的微生物種類，又可分為細菌氣溶膠、真菌氣溶膠、病毒氣溶膠等，對生物污染控制較關注的微生物氣溶膠粒子主要分布在0.1～20um范圍內，見下表：

生物污染控制就本質而言，與其它空氣中懸浮微粒污染控制的手段與方法是一致的，采取的主要手段與方法有：
1、采用空氣過濾器等物理方法把空氣中的懸浮微生物粒子阻隔下來，再將潔凈的空氣送入微生物污染控制區，以排除或稀釋控制區內被懸浮微生物所污染的空氣，達到控制室內或區內微生物污染水平的目的。
2、防止外界的微生物污染物以流動的空氣為載體侵入污染控制區，其基本手段仍是維持梯次的壓差以控制空氣流向等。
3、采取各種物理、化學方法減少污染控制區內微生物污染的散發，減少人員、物料等將微生物污染物攜帶入污染控制區。
除此之外，需要值得重視與注意的是，在微生物污染控制區所重點關注的是具有活性的微生物。所謂具有活性，意味著在條件適宜時這些微生物將繁殖。一般來說，因為空氣中缺少微生物直接可利用的養料，不易在空氣中生長繁殖。空氣微生物群是由暫時懸浮于空氣中的塵埃、液滴等攜帶的微生物所構成。當這些帶菌塵埃、液滴被阻留在空氣過濾器的迎風面上，或沉降、吸附在送風管道壁面或污染控制區的墻面、地面，如果微生物仍具有活性，在溫、濕度合適又有養分、水分提供時，就會大量繁殖。那些被空氣過濾器攔截、過濾下來的微生物甚至會生長透過到空氣過濾器的背風面，使經過空氣過濾器的干凈空氣又被二次污染，以致影響生物污染控制區域的污染水平。為此，國外的經驗是在空氣過濾器的迎風面設紫外線滅菌燈。由于近距離照射在空氣過濾器迎風面可獲得較大的輻照強度，再加上持續照射，使空氣過濾器迎風面上被攔截下來的微生物獲得較高的紫外線輻照劑量，可有效殺滅被阻留下來的微生物。
因此，對于生物污染控制區及空調凈化系統，適時進行化學藥劑噴灑、涂拭、臭氧熏蒸、紫外線照射等方式消毒滅菌是十分必要的，這也是生物污染控制有別于一般潔凈室的一個重要方面。單靠工業潔凈室的傳統措施是難于達到生物污染控制要求的。