1、排風風系統的劃分
國標《潔凈廠房設計規范》（GBJ 73-84）對局部排風系統的劃分有如下規定：
局部排風系統在下列情況下，應單獨設置：
（1）非同一凈化空調系統；
（2）排風介質混合后能產生或加劇腐蝕性、毒性、燃燒爆炸危險性；
（3）所排出的有害物毒性相差很大。
對于藥廠來說，青霉素等強制敏性藥物、某些淄體藥物、高活性、有毒害藥物的排風系統應單獨設置，以便特殊處理和管理。
2、排風系統的防倒灌措施
采取防倒灌措施的目的是，防止空調凈化系統停止運行時，室外空氣倒流入潔凈室，引起污染和積塵。一般常用的措施是在排風通路的適當位置設中效過濾器或設止回閥，或同時設置。對制藥廠的大部分排風系統來說，為了回收藥塵和防止排風污染廠區，在排入大氣前都經過旋風除塵器、袋式過濾器等分離裝置，而青霉素等致敏性藥品的排風系統末端還設有空氣過濾器，更具備了阻止室外臟空氣倒灌回潔凈室的能力，因此，一般不再需要另行考慮防倒灌措施。某些藥廠對排出的有害氣體采用水封措施，水中放置中和、分解有害氣體的化學物質、既化解了排出空氣中的有害成分，又兼有防止倒灌的作用。
3、排風系統的材質、設備
潔凈室內排風系統的風管、調節閥和止回閥等附件的制作材料和涂料，應根據排除有害物的性質及其所處的空氣環境條件確定。排除腐蝕性氣體的風管可采用塑料風管。排風管穿過放火墻處，應設置防火閥。含有易燃、易爆物質的局部排風系統，應有相應的防火、防爆措施，如選用防爆風機等。要特別注意藥廠排風系統的排風口與空調系統的新風采氣口保持足夠的水平距離及高差。青霉素等強敏性藥物、某些淄體藥物、高活性、有毒害藥物的排風口應裝置空氣過濾器，使這些藥物引起的污染危險降低到zui低限度。其排風口與其他藥物操作室空調系統的新風口之間，更應保持一定距離。
4、潔凈室內送風與排風的氣流組織
正因為排風口作用半徑小，有效范圍局限，因而室內氣流云頂走向主要決定于送風。所以送風與排風口、污染發生源等平面位置、空間相對關系在設計時顯得十分重要。如果送排風氣流組織得合理，能起到局部排風中常用的“吹吸罩”、“推挽罩”的效果，則對控制污染物在室內的擴散，提高室內潔凈度有明顯作用。這一點對于工藝工程常伴隨產塵的固體制劑來說十分值得注意。就一般原則來說，排風口、回風口均設在污染發生源的下風向。送入室內的潔凈空氣稀釋了被少量未能就近排走的污染物所污染的空氣后，在經過污染物發生源時給予所散發的污染物某個朝向排風口運動的動量，以推進所散發的污染物大量地向排風口作用范圍運動。